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EST #
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Analysis

EST #

EST (Expressed Sequence Tag)는 전체 유전자 중에서 특정한 시기나 부위에서 발현되고 있는 유전자를 말하며, cDNA의 전체 서열이 아닌 일부 서열만(300~500bp)이 확인된 것을 말한다. EST는 특정 조직이나 환경 조건에서 발현되는 mRNA를 역전사 (Reverse Transcription) 반응을 통해 생성된 cDNA를 5′- 이나 3′- end 부분을 염기서열화함으로써 생성된다. 쉽게 말해 유전자에서 인트론이 제거되고, 엑손의 일부만 연결된 DNA 서열이다. 따라서 EST는 샘플링할 때에 발현되는 유전자에 대한 정보만 제공할 뿐이고, intron이나 regulatory DNA에 대한 정보는 제공하지 못한다. 그럼에도 확보과 쉽다는 점에서 cDNA library의 증가와 더불어 EST의 수가 기하급수적으로 늘고 있으며, 발현유전자 분석을 통해 정확한 유전자 부위를 파악하고 유전자 발현 양상을 이해하고 있다. 유전체 정보가 없는 생물의 경우에도, 다양한 유전자를 확보하고 발달 단계나 특정 기능과 관련된 유전자를 파악하는데 발현유전자 데이터가 활용되고 있다.

EST 분석 #

EST 분석을 위해서는 mRNAcDNA(Complementary DNA)로 변환시켜 cDNA library를 만들어야 한다.

EST 분석 기술의 활용 #

  • 생명체의 genome으로부터 특정 시점에 발현하는 유전자 정보를 대량으로 수집할 수 있는 기법
  • 유전체 지도 작성 및 발현 유전자의 다형성 확보에 활용
  • 특정 종의 서로 다른 조직으로부터 발굴된 EST 정보들은 해당 조직의 기능과 특징을 알아내는 데에 활용

Reference #

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