면역
Epitope
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Introduction #
Epitope는 항원 결정 부위로써 Antigenic determinant라고도 한다. 한국어로는 항원결정기로 번역되며 항체 (Antibody)가 인식하고 결합할 수 있는 항원의 특정한 서열을 말한다 (위키백과 참고).
특히 CD4+ T-cell epitopes를 이용한 백신 개발이 많이 이루어지고 있어서 MHC class II 단백질을 이용한 peptide binding process를 통한 epitope prediction 등 분석이 많이 수행되고 있다.
Epitope mapping #
Protein Microarray, ELISPOT 또는 ELISA 등 방법을 이용하여 epitope 탐색이 가능하다.
- 연구사례 : 혈청학적 감별진단법 개발을 위한 뎅기 바이러스 특이 항원결정기 발굴 (링크)
MHC class I 및 [[MHC class II epitope는 epitope prediction을 통해서만 확인될 수 있다고 한다.
Odotope #
Weak shape theory로도 알려져 있으며 Olfactoy Receptor와 Ligand 간의 결합이 항원-항체 반응과 같이 특이적으로 이루어진다는 것으로 epitope의 개념과 유사하다 (위키백과 참고).
Minotope #
주로 펩타이드 서열의 고분자물질로 epitope의 구조를 모방하여 항체의 반응을 유도한다.
MimoDB #
보고된 minitopes 서열의 데이터베이스로 다운로드 및 검색 기능, structure visualization, BLAST 기능을 제공한다.
현재 2018년 1월 19일에 업데이트된 버전이 제공되고 있고 2010년 8월 최초 공개된 이후로 1년에 4회 정도씩 주기적으로 관리되고 있다.