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식물 유전체 데이터베이스 #
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Structured data

Category: Database

식물 유전체 데이터베이스는 육종을 위한 기초 정보를 제공한다.

Table of Contents

대표적인 식물 유전체 (포털) 사이트
각 식물별 유전체 데이터베이스

대표적인 식물 유전체 (포털) 사이트 #

사이트명	설명	주소
Ensembl	EnsemblPlants	https://plants.ensembl.org/index.html
Phytozome	The Plant Genomics Resource	https://phytozome-next.jgi.doe.gov/
PLAZA	plant comparative genomics	https://bioinformatics.psb.ugent.be/plaza/

각 식물별 유전체 데이터베이스 #

작물	학명	주소
애기장대	Arabidopsis thaliana	https://www.arabidopsis.org/
벼	Oryza sativa	https://rapdb.dna.affrc.go.jp/ http://rice.uga.edu/
보리	Hordeum vulgare	https://plants.ensembl.org/Hordeum_vulgare/Info/Index
밀	Triticum aestivum	https://plants.ensembl.org/Triticum_aestivum/Info/Index https://bioinformatics.psb.ugent.be/plaza/versions/plaza_v4_monocots/organism/view/Triticum+aestivum
조	Setaria italica	https://plants.ensembl.org/Setaria_italica/Info/Index https://phytozome-next.jgi.doe.gov/info/Sitalica_v2_2
수수	Sorghum bicolor	https://plants.ensembl.org/Sorghum_bicolor/Info/Index https://phytozome-next.jgi.doe.gov/info/Sbicolor_v3_1_1
옥수수	Zea mays	https://www.maizegdb.org/
콩	Glycine max	https://phytozome-next.jgi.doe.gov/info/Gmax_Wm82_a2_v1
동부 (cowpea)	Vigna unguiculata	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/GCF_004118075.1/
메디카고	Medicago truncatula	https://plants.ensembl.org/Medicago_truncatula/Info/Index https://www.jcvi.org/research/medicago-truncatula-genome-database
목화	Gossypium hirsutum	https://phytozome-next.jgi.doe.gov/info/Ghirsutum_v2_1
카사바	Manihot esculenta	https://phytozome-next.jgi.doe.gov/info/Mesculenta_v7_1 https://plants.ensembl.org/Manihot_esculenta/Info/Index
연근	Lotus japonicus	https://phytozome-next.jgi.doe.gov/info/Ljaponicus_Lj1_0v1 https://www.kazusa.or.jp/lotus/ https://lotus.au.dk/
포도	Vitis vinifera	https://plants.ensembl.org/Vitis_vinifera/Info/Index
키위	Actinidia deliciosa	https://kiwifruitgenome.org/
파파야	Carica papaya	https://bioinformatics.psb.ugent.be/plaza/versions/plaza_v3_dicots/organism/view/Carica+papaya

배추과(십자화과) #

작물	학명	주소
배추과	Brassicaceae	http://brassicadb.cn/#/
배추	Brassica rapa	brassicadb.cn/#/SpeciesInfo/
무	Raphanus sativus	http://radish-genome.org/

장미과 #

작물	학명	주소
장미과	Rosaceae	https://rosaceae.org/
체리	Prunus serotina	https://rosaceae.org/organism/24349
사과	Malus pumila	https://rosaceae.org/organism/24348
딸기	Fragaria × ananassa	https://rosaceae.org/organism/24345
복숭아	Prunus persica	https://rosaceae.org/organism/24333
아몬드	Prunus dulcis	https://rosaceae.org/organism/24336

가지과 #

작물	학명	주소
가지과	Solanaceae	https://solgenomics.net/
고추	Capsivum annuum	https://solgenomics.net/organism/Capsicum_annuum/genome
토마토	Solanum lycopersicum	https://solgenomics.net/organism/Solanum_lycopersicum/genome
감자	Solanum tuberosum	https://solgenomics.net/organism/Solanum_tuberosum/genome
담배	Nicotiana tabacum	https://solgenomics.net/organism/Nicotiana_tabacum/genome

박과 #

작물	학명	주소
박과	Cucurbitaceae	http://cucurbitgenomics.org/
수박	Citrullus lanatus	http://cucurbitgenomics.org/organism/1
오이	Cucumis sativus	http://cucurbitgenomics.org/organism/20
호박	Cucurbita moschata	http://cucurbitgenomics.org/organism/8
멜론	Cucumis melo	http://cucurbitgenomics.org/organism/18