유전자 기능 분석
온톨로지
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Table of Contents
Ontology 개요 #
- 온톨로지는 일종의 용어를 정의하는 계약이라 할 수 있음.
- 즉, 각 사물에서 공통점을 찾아내고 이를 하나의 집합 또는 범주로 나타내기 위해 의미, 지식의 쓰임새 등을 분명하고 자세하게 설명하는 것을 말함.
Plant Ontology #
정의 #
- A collection of ontologies developed by the Plant Ontology Consortium
- Anatomical structures and growth and developmental stages across Viridiplantae(Green Plant)
- A controlled vocabulary (ontology) that describes plant anatomy and morphology and stages of development for all plants (by http://www.plantontology.org/)
목적 #
- Multiple application including genetics, genomics, phenomics, and development, taxonomy and systematics, semantic applications and education
- To establish a semantic framework for meaningful cross-species queries across gene expression and phenotype data sets from plant genomics and genetics experiments. (by http://www.plantontology.org/)
프로젝트 맴버 #
- Oregon State University
- New York Botanical Garden
- L. H. Bailey Hortorium at Cornell University
- Ensembl
- SoyBase
- SSWAP
- SGN[disambiguation needed]
- Gramene
- The Arabidopsis Information Resource (TAIR)
- MaizeGDB
- University of Missouri at St. Louis
- Missouri Botanical Garden
관련 사이트 #
Gene Ontology #
정의 #
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생물학에서의 온톨로지(GO=Gene Ontology는 세 가지 독립된 수준에서 구분하여 정의함
- 분자 수준에서의 기능(Molecular Function) : 생화학적 수준에서 생산물에 따라 구분할 수 있다.
- 생명 대사(Biological Process) : 생물학적인 대사 과정에서의 역할에 따라 구분할 수 있다.
- 세포의 구성 요소(Cellular Component) : 세포 내 존재 위치에 따라 구분할 수 있다.
