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Carbohydrate-Active enZYmes #
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Carbohydrate-Active enZYmes #

  • CAZy 데이터베이스

  • CAZy 데이터베이스는 glycosidic bonds의 결합, 분해, 수정에 관여하는 효소들의 구조 및 기능적 도메인 정보를 담고 있는 데이터베이스이다.

  • 미생물에서 식물, 동물에 이르기까지 탄수화물 대사와 관련된 단백질 효소의 서열을 정보화한다.

  • 효소 활성에 따라 1차 5개의 class로 구분되며, 이들이 다시 2차 sub-class로 구분되는 categorization 되어있다.

    1. Glycoside Hydrolases (GHs) : hydrolysis and/or rearrangement of glycosidic bonds

    2. GlycosylTransferases (GTs) : formation of glycosidic bonds

    3. Polysaccharide Lyases (PLs) : non-hydrolytic cleavage of glycosidic bonds

    4. Carbohydrate Esterases (CEs) : hydrolysis of carbohydrate esters

    5. Auxiliary Activities (AAs) : redox enzymes that act in conjunction with CAZymes.

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Reference annotation #

  • Genome이 완성되어 있으며, 종내 유전자 주석이 완료된 종들을 대상으로 CAZy database의 분류체계(classification)에 따라 탄수화물 대사에 관여하는 유전자들을 categorization 하였다.
  • http://www.cazy.org/Genomes.html

    • Bacteria : 21,944 종

    • Viruses : 457 종

    • Archaea :431 종

    • Eukaryota : 359 종

  • 데이터베이스 다운로드 : http://www.cazy.org/IMG/cazy_data/cazy_data.zip

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