Circos
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Structured data
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Circos는 데이터와 정보를 가시화하는 소프트웨어 패키지로, 표현하는 대상간의 관계나 위치를 원형구조로 가시화하는데 유용하다 (http://circos.ca/).
UNIX 환경에서 다루기 쉬운 테이블 구조의 자료와 Gnuplot과 유사한 사용방식을 제공하고 있다.
간략한 사용법은 정명희씨의 포스트를 참고하면 좋다.
다음은 포스트 일부 발췌내용이다.
Circos(http://circos.ca/)는 데이터를 시각화하는 Perl 기반의 소프트웨어 패키지로써 circular layout을 이용한다는 특징이 있습니다. 다양한 track과 plot 타입을 사용할 수 있어 변이나 genomic interval간의 관계를 표현하는데 유용하기 때문에 근래 유전체 분석 및 비교 유전체 분석 논문에서는 필수 피겨로 자리매김하고 있습니다. [그림 1]은 염색체 간 서열의 유사성을 두 가지 map으로 표현하고 있는데 왼쪽은 일반적인 genetic map의 형태로써 모든 염색체를 하나의 그림에 표현하기 어렵고 1:1 비교만 표현할 수 있다는 단점이 있는 반면 오른쪽의 Circos map은 1:1 비교뿐만 아니라 모든 염색체 간 서열의 연관 관계를 표현할 수 있다는 장점이 있습니다.
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