COSMIC #

Catalogue of Somatic Mutations in Cancer 암에 관련된 체세포 돌연변이에 대한 정보를 담고 있는 데이터베이스다. Wellcome Trust Sanger Institute에서 구축

종류 #

• COSMIC
• COSMIC Whole Genomes
• COSMIC Cell Lines Project
• COSMIC Genome Browser

검색 #

COSMIC 메인 화면에 검색창이 있다. 이 검색창은 다음과 같은 검색어를 인식한다.

1. 유전자이름, HUHO synonym (eg.BRAF, B-raf)
2. 조직이나 암의 종류 (long, colon)
3. 돌연변이의 위치 및 코돈이나 아미노산변환이 들어간 설명 (c.543T>A p.D12E)
4. 1,3번을 함께
5. COSMIC 샘플ID나 샘플이름

검색결과 #

검색어가 포함하고 있는 항목을 타입별로 표로 보여준다. 아래의 탭을 선택하면 각 항목에 해당하는 리스트들을 보여주며, 클릭하면 더 자세한 정보를 보여주는 페이지로 연결된다.

유전자의 경우 Genome Browser도 함께 포함하고 있다.

데이터타입 #

• Aberrant Gene Expression
• CNV (Copy Number Variants)
• Substitutions
• Insertions/Deletions
• Structural Variants
• Non-Coding Variants
• Gene Fusions

Suggested Pages #

• 0.025 HGMD
• 0.025 DNA
• 0.013 핵산
• 0.006 퓨린염기
• 0.006 피리미딘염기
• 0.006 우라실
• 0.006 티민
• 0.006 인산기
• 0.006 염기
• 0.006 피리미딘 염기
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