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Fluidigm #
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SNP genotyping assay #

형광을 통해 bi-allele SNP를 간단하고 신속하게 확인할 수 있는 high-throughput tool이다.

3종류의 primers (STA, LSP, ASP1&2)와 2종류의 probes (FAM, HEX)를 사용하여 Dynamic Array integrated fluidic circuits (IFCs) 상에서 2가지 타입의 SNP를 구분하며, 65%이하의 GC contents에서 80%이상의 성공률을 가진다.

Workflow #

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1. Assay design #

Bi-alleles을 가지는 하나의 SNP를 분석하도록 assay마다 3종류 (4개의 primers)를 제작한다. Fluidigm社는 자체 프로그램 (D3 assay design)을 통해 고객의 assay에 적합한 primer sets를 제공하고 바로 주문 가능하도록 하고 있다.

• Specific Target Amplification (STA) primer • Locus-Specific Primer (LSP) • Allele-Specific Primers (ASP) 1 & 2

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