Gene Expression Omnibus
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GEO #
GEO(Gene Expression Omnibus)는 대용량 기능 유전체학 데이터인 마이크로어레이, 차세대 염기서열 분석 등의 데이터를 저장하는 국제적인 공용저장소임. 데이터의 저장 뿐만 아니라 웹 기반의 인터페이스와 어플리케이션들을 제공하여 사용자로 하여금 GEO에 저장된 유전자 발현 패턴들을 검색하고 활용할 수 있도록 지원하고 있음. GEO는 미국 NCBI (National Center for Biotechnology Information)에 의해 운영되고 있으며, http://www.ncbi.nih.gov/geo/에 접속하여 이용 가능
2016년 6월 초 현재 3,848건의 DataSet와 69,229건의 Series, 15,913건의 Platform으로 1,816,869건의 Sample 정보가 등록되어 있음.
GEO의 세 가지 주요 목표 #
- 대용량의 기능 유전체 데이터를 효율적으로 등록할 수 있는 데이터베이스 제공
- 연구 커뮤니티에서 전폭적인 지원과 적절히 주석처리 된 데이터를 저장할 수 있는 간단한 제출 절차와 형식을 제공
- 사용자가 조회, 검토 및 다운로드 연구와 관심의 유전자 발현 프로파일을 찾을 수 있도록 사용자 친화적 인 메커니즘을 제공
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