Human Ageing Genomic Resouces(HAGR)은 여러 노화 데이터베이스를 포함하고 있는 메타 DB로 GenAge, GenDR, AnAge, LongevityMap DB에 접근할 수 있다. 영국 리버풀대의 Integrative Genomics of Ageing Group에서 유지관리하고 있으며 전체 DB에 대한 일괄 검색과 다운로드를 제공한다.
Table of Contents
GenAge #
HAGR의 핵심 DB로 인간과 8종의 모델생물(mouse, fruit fly, roundworm, baker's yeast 등)의 노화 및 장수 관련 유전자를 전문가의 문헌 큐레이션을 통해 수집한 결과를 제공한다. 이 데이터는 인간노화 단백질 네트워크 등 시스템 수준의 노화연구에 널리 이용되고 있으며, 노화관련성, 염색체 위치, 단백질 네트워크, 근거문헌 등을 제공한다.
데이터양은 아래와 같다.
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Human Ageing Genes |구분|데이터 수| |-|-| |Human Gene | 298 | |GO categories|12,475| |Homologues|2,448| |Interactions|710| |References|3,936| |Bibliographical records|2372|
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Model Organism Ageing Genes |구분|데이터 수| |-|-| |Caenorhabditis elegans genes|741| |Danio rerio genes|1| |Drosophila melanogaster genes|140| |Mesocricetus auratus genes|1| |Mus musculus genes|112| |Podospora anserina genes|3| |Saccharomyces cerevisiae genes|825| |Schizosaccharomyces pombegenes|2| |Total genes|1,825| |Bibliographical records|531|
업데이트 기준: January 27, 2015 http://genomics.senescence.info/genes
GenDR #
AnAge #
LongevityMap #
The Digital Ageing Atlas #
LibAge #
웹사이트 #
http://genomics.senescence.info/
논문 #
Tacutu, R., Craig, T., Budovsky, A., Wuttke, D., Lehmann, G., Taranukha, D., Costa, J., Fraifeld, V. E., de Magalhaes, J. P. (2013) "Human Ageing Genomic Resources: Integrated databases and tools for the biology and genetics of ageing." Nucleic Acids Research 41(D1):D1027-D1033. PubMed