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HAGR #
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Structured data

Category
Database

Human Ageing Genomic Resouces(HAGR)은 여러 노화 데이터베이스를 포함하고 있는 메타 DB로 GenAge, GenDR, AnAge, LibAge, LongevityMap, The Digital Ageing Atlas DB에 접근할 수 있다. 영국 리버풀대의 Integrative Genomics of Ageing Group에서 유지관리하고 있으며 전체 DB에 대한 일괄 검색과 다운로드를 제공한다.

GenAge #

HAGR의 핵심 DB로 인간과 8종의 모델생물(mouse, fruit fly, roundworm, baker's yeast 등)의 노화 및 장수 관련 유전자를 전문가의 문헌 큐레이션을 통해 수집한 결과를 제공한다. 이 데이터는 인간노화 단백질 네트워크 등 시스템 수준의 노화연구에 널리 이용되고 있으며, 노화관련성, 염색체 위치, 단백질 네트워크, 근거문헌 등을 제공한다.

데이터양은 아래와 같다.

  • Human Ageing Genes
구분 데이터 수
Human Gene 305
GO categories 12,553
Homologues 2,448
Interactions 741
References 3,936
Bibliographical records 2496
  • Model Organism Ageing Genes
구분 데이터 수
Caenorhabditis elegans genes 838
Danio rerio genes 1
Drosophila melanogaster genes 170
Mesocricetus auratus genes 1
Mus musculus genes 126
Podospora anserina genes 3
Saccharomyces cerevisiae genes 883
Schizosaccharomyces pombegenes 31
Total genes 2,054
Bibliographical records 640

*업데이트 기준: October 11, 2015 * http://genomics.senescence.info/genes

웹사이트 #

http://genomics.senescence.info/

논문 #

Tacutu, R., Craig, T., Budovsky, A., Wuttke, D., Lehmann, G., Taranukha, D., Costa, J., Fraifeld, V. E., de Magalhaes, J. P. (2013) "Human Ageing Genomic Resources: Integrated databases and tools for the biology and genetics of ageing." Nucleic Acids Research 41(D1):D1027-D1033. PubMed

0.0.1_20210630_7_v33