InterPro
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InterPro #
InterPro는 단백질 서열을 이용하여 family로 분류하고 도메인과 중요한 사이트를 예측하여 기능 분석을 제공하는 데이터베이스입니다. InterPro는 다양한 다른 데이터베이스에서 제공하는 예측모델과 알려진 시그니쳐를 이용하여 단백질을 분류합니다.
사용방법 #
InterPro 홈페이지에 접속(https://www.ebi.ac.uk/interpro)하면 메인 화면에 시퀀스를 입력할 수 있는 칸이 있습니다. 이때 넣어주는 시퀀스는 알파벳 한 글자의 단백질 서열이며 별도의 회원가입 없이 사용 가능합니다. 그 외에도 InterPro ID를 이용하여 해당하는 단백질의 자세한 정보를 제공해주기도 합니다.
또한, Blast2GO에서도 InterPro 데이터베이스를 이용하여 단백질 서열에서의 기능 분석을 할 수 있습니다.
InterProScan #
InterProScan은 InterPro에 있는 데이터베이스를 이용하여 시퀀스로 하여금 스캐닝할 수 있도록 만들어진 소프트웨어 패키지입니다.
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