Microsatellite
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Microsatellite #
Microsatellite는 법의학자들은 STR(Short Tandem Repeat)이라고도 하며, 식물유전학자들은 SSR(Simple Sequence Repeat)이라고도 한다. Microsatellite는 반복 염기서열 수의 차이로 보이는 유전변이형 종류 중 하나이다. 반복되는 염기서열이 2~7bp로 짧은 염기서열이 반복되는 것이다.
Microsatellite의 이용 #
유전연구를 하는 분야에서는 microsatellite와 SNP 마커가 주로 개체식별용으로 사용되고 있다.
Microsatellite와 SNP의 비교 #
| Microsatellite (STR) | SNP |
|---|---|
| 유전적 전달의 정확성이 낮음 (마커의 반복 수 팽창 및 상대적으로 높은 돌연변이율) | 유전적 전달의 정확성이 매우 높음 |
| 인간 유전체에 약 50,000개 이상 존재 | 2개의 인간 유전체간에는 ~1 SNP/Kb 존재하고 총 약 300만개 정도의 SNP이 있음 |
| 최초의 유전지도(genetic map) 작성에 이용 | 연관성 연구(association studies)에 이용 |
STR 외 반복 염기서열 유전변이 형 #
- VNTR (Variable Number of Tandem Repeats) : 반복되는 염기서열이 14~17bp
- 일반적으로 2개의 염기서열 반복이 가장 일반적 (전체 유전체의 약 0.5%)
- CA 반복(36kb당 하나), AT 반복(50kb당 하나), AG 반복(125kb당 하나)
- 반복서열 다형성은 법의학 분야에서 개인 식별이나 유전자 감식을 통한 친자 확인에 활용
출처 : 질병 유전체 분석법 3 참조
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