Oncomine Power Tools #

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최초 작성자
Hey-young 2015-09-26 17:13:55
최근 업데이트
4everYoung 2016-07-01 00:06:15

Structured data

Category: Software

Oncomine™ Power Tools #

[그림1] Cancer cell lines의 유전자 Copy number

샘플수준 드릴다운 기능을 통해 단일 스냅샷 뷰에서 모든 암 유형의 중요 변이를 식별가능
여러 임상 데이터세트에서 초점 증폭(focal amplication)을 식별하고 핵심(driver) 증폭/결손과 일과성(passenger) 증폭/결손을 구분.
여러 독립적인 데이터세트에서 여러 암 유형의 차별적 발현을 식별 및 확인.
특이적 유전자의 돌연변이 빈도를 조사하거나 암 유형에서 가장 많이 발생하는 돌연변이를 식별
2014년 보고에 따르면 8,000개 넘는 샘플 (42개의 cancer types 포함)

Database Contents #

COSMIC cell lines Project
Broad GDAC Mutation Packager의 TCGA 데이터
DCC level2의 TCGA데이터
TCGA 데이터를 Oncomine mutation call함
NGS mutation에 대한 문헌정보들

Oncomine™ Power Tool과 Oncomine™ NGS Power Tool 비교 #

[그림2] Oncomine™ Power Tool과 Oncomine™ NGS Power Tool 비교

[그림3] KRAS mutation

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