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Short Tandem Repeat
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Short Tamdem Repeat #
Short Tamdem Repeat(STR)은 2개 이상의 DNA 염기패턴이 반복적으로 나타나는 것은 말한다. 염기서열패턴은 2 base ~ 16 base 사이로 non-coding intron region에서 흔히 나타난다. 특정 위치의 STR을 관찰함으로써 개인간의 genetic profile을 밝혀낼 수 있다. 특히 Autosomal STR (A-STR)는 법의학 분야에서 흔하게 사용하되는 분석법 중 하나이고, Y-chromosome STRs (Y-STR)은 genealogical DNA testing에 사용된다.
STR과 SNP #
Genome 연구에서 가장 많이 사용하는 것은 'SNP'와 'STR' 이다. 둘 간의 차이는 아래와 같다.
| STR(microsatellite) | SNP |
|---|---|
| 더 다향한 allele가 존재함 -> 각 개체간 유전적 차이 구분 세밀 | 오직 두 종류의 allele만 존재하지만 워낙 많은 SNP형이 존재함으로 커버가능 함 |
| 최초 유전지도 작성 | complex traite의 association study에 이용 |
표2: STR vs. SNP (출처: 질병유전체분석법)
STR 데이터베이스 #
- STRBase: forensic DNA typing을 위한 STR marker 정보를 모아놓은 데이터베이스
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