Database #

개요 #

Informatics for Integrating Biology and the Bedside (i2b2)는 i2b2 tranSMART Foundation에서 운영하는 프로젝트이다. 약어 i2b2는 풀네임의 이니셜, 'I' 2개와 'B' 2개를 의미하는 것으로 추정된다. i2b2 tranSMART Foundation의 목적은 효과적인 정밀 의료를 이룩하기 위한 전산학적인 문제를 해결하고 이를 오픈소화 하여 배포하는 것이다. 여기서 언급한 전산학적인 문제는 임상데이터와 유전체 데이터의 공유, 통합, 표준화, 이종 데이터 사이에서의 데이터 분석 등을 포함한다.

조직 #

i2b2 tranSMART Foundation은 미국 NIH의 National Center for Biomedical Computing에서 운영하던 i2b2 Foundation과 Johnson & Johnson와 Recombinant Data Corporation 에서 개발한 tranSMART를 유지하던 tranSMART Foundation이 합병된 조직이다.

운영 #

임상연구 분야의 방법은 단순히 의무기록을 바탕으로 한 연구에서 환자의 진료 기록을 전산화시킨 전자건강기록(electronic health record, EHR)을 활용하게 되었고, 최근에는 EHR 데이터를 각 환자의 유전체 정보와 결합한 연구가 시도되고 있다.

i2b2는 특히 다기관의 의료정보와 유전체 정보를 통합하는 것을 목표로 하고 있다. 이를 위하여 i2b2는 오픈소스 프로젝트로 운영되고 있으며, 소스코드도 공유되고 있고 활용 방법 또한 wiki를 이용하여 공개되고 있다. i2b2의 대표적인 특징 중에 하나는 ontology-driven architecture 라고 할 수 있는데, 데이터 관리, 저장 등의 핵심 기능들을 모두 모듈화 하여 개발하고 이를 활용하기 위한 클라이언트와 플러그인들 직접 개발하고 사용할 수 있도록 구현되어 있다. 클라이언트 툴에서는 일반 임상 연구자도 활용할 수 있도록 길고 복잡한 쿼리문을 작성하는 것이 아니라 시각화 기반의 쿼리를 만들 수 있는 UI로 만들어져 있다.

참고 #

• https://www.i2b2.org/software/index.html
• https://transmartfoundation.org/about-us